En el año 1500, Yesa formaba parte del Reino de Navarra, que en esa época estaba bajo el reinado de Catalina de Foix y su esposo Juan III de Albret. Durante este período, Navarra enfrentaba presiones externas, especialmente de la Corona de Castilla y de Francia, lo que llevó a conflictos que marcarían el destino del reino en las siguientes décadas.